دوره آموزشی شبیه سازی دینامیک مولکولی
مدت دوره: 10 ساعت 6 جلسه
هزینه دوره:
شروع دوره:
سرفصل و محتوای دوره:
مقدمه اي بر دینامیک مولکولی و بیان کاربرد های آن در علوم مختلف
معرفی و آموزش سیستم عامل لینوکس، اجرای دستورات پر کاربرد لینوکس
آشنایی با مبانی دینامیک مولکولی ( میدان نیرو، شرایط مرزی متناوب، گام زمانی و شعاع قطع ....)
اشنایی و معرفی انواع پکیج های شبیه سازی دینامیک مولکولی AMBER، GROMACS، NAMD و ..
آماده سازی فایلهای ورودی (فایل¬های ساختاری pdb و gro) برای استفاده در GROMACS،
آشنایی با محیط نرم افزار GROMACS و بخش های مختلف آن
انجام شبیه سازی دینامیک مولکولی پروتئین لیگاند : ایجاد جعبه شبیه سازی برای ساختار مورد نظر و حلال پوشی آن ، حداقل رسانی انرژی، تعادل رسانی ساختار مورد مطالعه، بررسی خواص کنترلی و نمونه برداری
تجزیه و تحلیل نتایج حاصل از شبیه سازی دینامیک مولکولی
آموزش نرم افزار کمکی VMD
اهداف :
ایجاد توانایی در مخاطبان به منظور استفاده از تکنیک دینامیک مولکولی، آشنایی با انواع کاربردهای ذینامیک مولکولی، ایجاد توانایی در مخاطبان جهت شبیه سازی سیستم های زیستی ساده و پیچیده، توانایی در شناسایی انواع خطاها و رفع موانع در هنگام اجرا برنامه، توانایی در آنالیز و تفسیر نتایج دینامیک مولکولی،
مخاطبان دوره:
فارغ التحصیلان و دانشجویان کارشناسی، کارشناسی ارشد، و دکترای انواع گرایش های شیمی، بیوتکنولوژی پزشکی و دارویی، میکروبیولوژی، کشاورزی، ژنتیک،باکتری شناسی، ویروس شناسی، ایمونولوژی، قارچ شناسی، انگل شناسی، بیوشیمی،فرآورده های بیولوژیک،زیست شناسی، پزشکی و محققین مشغول در تحقیقات دارویی پزشکی و کشاورزی
توجه: برای شرکت کنندگان برگزیده در این دوره پروژه تحقیقاتی مشترک در نظر گرفته خواهد شد
ثبت نام و پرداخت شهریه از طریق لینک زیر